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    Title: 以電腦模擬探討腸病毒71型在VP1與3C蛋白?上的抑制劑研究
    Study of VP1 and 3C Protease for Enterovirus 71 for inhibitor’s binding site
    Authors: 林明粲
    Contributors: 生物資訊學系碩士班
    Date: 2009
    Issue Date: 2009-10-12 18:35:40 (UTC+8)
    Publisher: 亞洲大學
    Abstract: 十一年前台灣曾爆發腸病毒的大流行,造成十三萬名的通報病例,78名孩童死亡,405名孩童引發嚴重的併發症。之後,每年台灣都還有傳出腸病毒71型 (Enterovirus 71) 的病例,而至今仍還未研發出有效抑制腸病毒71型的抑制劑。
    隨著近年來計算機的進步以及生物資訊 (Bioinformatics) 的發展,利用電腦模擬配合生物科技或分子醫學相關的知識及應用,以同源模擬 (homology modeling) 的方法可模擬出腸病毒71型的外鞘蛋白VP1 (capsid _VP1)及3C蛋白酶(3C_ protease)的三維立體結構,再利用分子嵌合軟體 AutoDock 與文獻中找出的 Ligand進行嵌合計算。針對分子嵌合後的結合位置做分析,計算出平衡結合能及抑制常數Ki等能量值,以及分析病毒蛋白與Ligand之間的氫鍵作用力,氫鍵在分子結合過程中也是非常重要的參考依據。
    研究結果得到Ligand 4有不錯的表現力,並且可取代VP1上的類脂肪分子穿過疏水性凹槽與VP1結合,而Ligand AG7088與3C蛋白酶也有不錯的表現力,未來可利用研究結果以實驗方式找出可能抑制腸病毒71型的前導藥物。
    Appears in Collections:[生物資訊與醫學工程學系 ] 博碩士論文

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